Introduction

La bioinformatique est l'utilisation des bases de données informatiques et des algorithmes informatiques pour analyser les protéines, les gènes et la collection complète d'acide désoxyribonucléique (ADN) comprenant un organisme (le génome). Un défi majeur en biologie est de donner un sens aux énormes quantités de données de séquence et de données structurelles générées par les projets de séquençage du génome, la protéomique et d'autres efforts de biologie moléculaire à grande échelle. Les outils de la bioinformatique comprennent des programmes informatiques aidant à révéler les mécanismes fondamentaux sous-jacents aux problèmes biologiques liés à la structure et à la fonction des macromolécules, aux voies biochimiques, aux processus pathologiques et à l'évolution.

La programmation de la bioinformatique peut se faire à l'aide modules Perl (BioPerl), de module Python (Biopython), en .NET (Infer.NET) et du langage de programmation R. Aussi, il existe également des outils comme BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), permettant de trouver des régions de similitude entre les séquences biologiques de nucléotides ou de protéines à partir d'une base de données. Aussi, des logiciels comme MEGAHIT permettent assembler des séquences d'ADN à partir de données de séquençage à haut débit NGS (Next-Generation Sequencing).