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Le logiciel BLAST, tirant son nom de l'anglicisme Basic Local Alignment Search Tool, permet de trouver des régions de similitude entre les séquences biologiques. Le programme compare les séquences de nucléotides ou de protéines aux bases de données de séquences et calcule la signification statistique. Le logiciel BLAST est l'outil principal du NCBI (National Center for Biotechnology Information) pour la comparaison de séquence d'ADN (Acide désoxyribonucléique) ou de protéine avec d'autres séquences de base de données variés. Le logiciel BLAST est ensemble de commandes permettant d'effectuer des recherches en ligne de commandes. Le logiciel BLAST a été le premier programme à attribuer des statistiques rigoureuses à des scores utiles d'alignements de séquences locales. Auparavant, les gens devaient faire de nombreux dérivé de systèmes de notation différents, et il n'était pas clair pourquoi certains de ses systèmes devaient avoir un avantage particulier.

Remarque

• Il existe également une version en ligne.